В августе 1994 года по обвинению в передаче ЦРУ сведений о новейших гидроакустических системах задержан старший научный сотрудник одного из военно-морских НИИ Петербурга Моисей Финкель. 16 мая 1997 года Мосгорсуд приговорил его к 12 годам строгого режима с конфискацией имущества.
В июне 1999 года за попытку передачи иностранным спецслужбам секретных сведений о новых видах авиационного вооружения задержан младший научный сотрудник 30-го ЦНИИ Минобороны подполковник Сергея Авраменко. 12 июля 2000 года Московский окружной военный суд признал его виновным в госизмене и приговорил к 4 годам тюрьмы.
3 июля 1999 года при обыске у завлабораторией ядерной океанологии Тихоокеанского океанологического института РАН профессора Владимира Сойфера найдены "документы закрытого характера". 11 февраля 2000 года Советский райсуд Владивостока в связи с преклонным возрастом подозреваемого отказал в возбуждении дела о разглашении гостайны, однако ученый настоял на рассмотрении дела судом. 19 декабря 2000 года Приморский крайсуд оправдал профессора.
31 августа 1999 года приморскими таможенниками задержана аппаратура, направленная в КНР в рамках контракта по исследованиям акустических свойств моря Тихоокеанским океанологическим институтом. Руководитель лаборатории акустических шумов института Владимир Щуров обвинен в экспорте военных технологий, контрабанде и разглашении гостайны. 25 августа 2003 года Приморский крайсуд приговорил его к двум годам условно и амнистировал.
27 октября 1999 года в Обнинске по обвинению в передаче представителям британской фирмы Alternative Future секретных сведений о новейших видах оружия задержан завсектором военно-технической и военно-экономической политики отдела внешнеполитических исследований института США и Канады РАН Игорь Сутягин. 7 апреля 2004 года Мосгорсуд на основании решения присяжных приговорил его к 15 годам тюрьмы.
4 апреля 2000 года при передаче ТТХ противолодочной торпеды "Шквал" американцу Эдмонду Поупу задержан профессор МГТУ имени Баумана Анатолий Бабкин. 19 февраля 2003 года Мосгорсуд приговорил его к 8 годам условно.
8 мая 2000 года красноярское УФСБ возбудило дело против главы Теплофизического центра при Красноярском техническом университете Валентина Данилова, обвинив его в передаче секретов Китайской академии космических технологий. Позже добавилось обвинение в присвоения средств, выделенных китайцами на общие проекты. 30 декабря 2003 года присяжные Красноярского крайсуда оправдали физика. 24 ноября 2004 года при пересмотре дела он получил 14 лет строгого режима. 29 июня 2005 года Верховный суд снизил срок до 13 лет.
29 марта 2003 года ФСБ возбудила дело против директора Института проблем сверхпластичности металлов РАН Оскара Кайбышева, обвинив его в разглашении гостайны, передаче в Южную Корею двойных технологий и в финансовых махинациях. 2 марта 2005 года статья о разглашении гостайны снята. С 10 ноября 2005 года дело слушается в Верховном суде Башкирии.