Заместитель главного редактора "Новой газеты", депутат Госдумы от партии "Яблоко" Юрий Щекочихин скончался 3 июля 2003 года в Центральной клинической больнице. Согласно официальному диагнозу, причиной смерти стал отек мозга, вызванный аллергическим синдромом Лайелла. При этом заключение о смерти врачи родственникам не выдали, сославшись на врачебную тайну. В день смерти журналиста председатель комитета Госдумы по безопасности Александр Гуров обратился в Генпрокуратуру с просьбой возбудить уголовное дело. Проверку поручили Кунцевской межрайонной прокуратуре, которая криминальной подоплеки в смерти журналиста не нашла.
В августе 2006 года коллектив "Новой газеты" запросил Генпрокуратуру о еще одной проверке обстоятельств смерти Юрия Щекочихина. По мнению газеты, не было установлено вещество, спровоцировавшее аллергическую реакцию. Та же Кунцевская прокуратура вновь отказала в возбуждении дела, заявив, что причиной болезни могли стать пищевые добавки и лекарства, которые принимал Щекочихин.
В октябре 2007 года в ответ на просьбу главного редактора "Новой газеты" Дмитрия Муратова следственный комитет при Генпрокуратуре начал дополнительную проверку. В качестве одной из версий смерти называлось радиоактивное заражение. 24 марта 2008 года следственный отдел по Кунцевскому району Москвы пришел к тем же выводам, что и прежние проверки. 25 марта председатель следственного комитета при прокуратуре РФ Александр Бастрыкин, не удовлетворившись таким решением, поручил расследование московскому городскому следственному управлению.