В феврале 2006 года Борис Березовский объявил, что Бадри Патаркацишвили выкупит у него все активы в совместном бизнесе. Политэмигрант объяснил свое решение стремлением "снять политические риски с бизнеса Бадри". После этого господин Патаркацишвили стал контролировать среди прочего 100% издательского дома "Коммерсантъ" (продал его в августе того же года). Среди других активов бизнесмена был инвестфонд Bary Discovered Partners, владеющий корпорацией Georgian Glass and Mineral Waters (производитель минеральной воды "Боржоми"), и ряд предприятий пищевой промышленности в Грузии и Сербии. Бадри Патаркацишвили также владел контрольным пакетом акций грузинского медиахолдинга "Имеди", акциями телекомпаний "Мзе" и "Первое стерео". Ему принадлежало 49,9% грузинского сотового оператора Magticom. Среди других активов господина Патаркацишвили были пакеты акций футбольного и баскетбольного клубов "Динамо" (Тбилиси) и доля в бразильском футбольном клубе "Коринтианс".