13 января 2004 года при выходе из штаба НБП в Москве лидер общественного движения "Россия без Путина" Дмитрий Бахур подвергся нападению людей в штатском, а затем похищен. Позже господин Бахур сообщил, что он был вывезен на автомобиле "Волга" за МКАД и "зверски избит" сотрудниками ФСБ. По его словам, избиением "руководил" полковник ФСБ Фролов. 14 января пострадавший доставлен в больницу с ушибами и переломами. О возбуждении уголовного дела, равно как и о ходе следствия, не сообщалось.
27 июля 2004 года после завершения акции протеста у здания ФСБ РФ на Лубянской площади в Москве активисты партии "Яблоко" подверглись нападению со стороны людей в штатском. По словам пресс-секретаря московского отделения "Яблока" Сергея Казакова, нападавшие ловили участников митинга в переулках и жестоко избивали. О расследовании инцидента не сообщалось.
29 августа 2005 года в Москве возле здания общественной приемной КПРФ на улице Автозаводская группа неизвестных в масках напала на представителей леворадикальной молодежи. В больницу доставлены четверо нацболов, один из них — с переломами обеих рук. Нападавшие были задержаны милицией, но вскоре отпущены. По данным СМИ, преступники были футбольными фанатами. Возбуждено уголовное дело, идет следствие.
16 ноября 2005 года на станции метро "Чернышевская" в Санкт-Петербурге группа подростков численностью около 20 человек напала на семерых активистов НБП и "Авангарда красной молодежи" (АКМ), которые возвращались с антифашистского фестиваля. Лимоновец Александр Колосов и лидер петербургского отделения АКМ Максим Малышев с тяжелыми травмами доставлены в больницу. Пресс-служба НБП распространила заявление, в котором говорится, что нападение совершили члены организации "Наши" по приказу ФСБ. О ходе расследования инцидента не сообщалось.
13 февраля 2006 года в Волгограде совершено нападение на руководителя регионального отделения "Родины" Дмитрия Коломыцева и его жену. Господину Коломыцеву проломили череп молотком, а его супругу ударили бейсбольной битой. Оба остались живы. По словам лидера фракции "Родина" Дмитрия Рогозина, нападение было совершено по политическим мотивам, а лидер нижегородской "Родины" Вячеслав Растеряев заявил: "Власть дала понять, что шутить далее не намерена".
20 марта 2006 года в Москве напали на Марину Литвинович, советника лидера Объединенного гражданского фронта Гарри Каспарова. Нападавшие ударили госпожу Литвинович тяжелым предметом по голове, затем нанесли несколько ударов по лицу. Ценных вещей и денег не взяли. Как заявила пострадавшая, нападение на нее являлось "околовластным заказом" и было связано с ее работой в общественной организации "Голос Беслана".