Василий Шахновский, экс-президент "ЮКОС-Москва". 5 февраля 2004 года Мещанским судом Москвы признан виновным в неуплате налогов на 28,5 млн руб. (ст. 198 ч. 2 УК РФ), приговорен к году тюрьмы. Прокурор требовал приговорить бизнесмена к 1,5 года лишения свободы с отбыванием срока в колонии-поселении. Освобожден в связи с "изменением обстоятельств" (выплатил 53 млн руб. с учетом штрафов).
Алексей Пичугин, экс-начальник отдела службы безопасности НК ЮКОС. 30 марта 2005 года коллегией присяжных Мосгорсуда признан виновным по ст. 105 в убийстве бизнесмена Сергея Горина и его супруги, покушении на убийство экс-советника мэра Москвы по имиджу Ольги Костиной и сотрудника "Роспрома" Сергея Колесова и приговорен к 20 годам строгого режима. Гособвинитель требовал приговорить его к пожизненному заключению. В течение 2005 года прокуратура предъявила Алексею Пичугину новые обвинения — в организации убийства и покушениях на убийство по найму. Сидит в СИЗО "Матросская Тишина".
Михаил Ходорковский, экс-председатель правления НК ЮКОС, и Платон Лебедев, председатель совета директоров МФО МЕНАТЕП. 31 мая 2005 года признаны Мещанским судом виновными в двойном мошенничестве (ст. 159), злостном неисполнении решения суда (ст. 315), присвоении и растрате (ст. 160), причинении крупного имущественного ущерба собственникам без признаков хищения (ст. 165), организации уклонения от уплаты налогов от организаций (ст. 199) и в качестве физлиц (ст. 198) и приговорены каждый к 9 годам колонии общего режима (прокурор требовал назначить для обоих наказание в виде 10 лет тюрьмы). Также их обязали по иску МНС выплатить солидарно 17,4 млрд руб. 22 сентября 2005 года Мосгорсуд сократил обоим наказание на год. Михаил Ходорковский отбывает наказание в колонии ИК-10 (Читинская область), Платон Лебедев — в учреждении ОГ 98/3 (ЯНАО).
Андрей Крайнов, бывший гендиректор АОЗТ "Волна" ("дочка" ЮКОСа). 31 мая 2005 года Мещанским судом признан виновным по ст. 159, 165 и 315. Приговорен к 5 годам условно в связи с раскаянием и частичным признанием вины. Гособвинитель просил суд назначить наказание в виде 5,5 года лишения свободы условно с испытательным сроком 5 лет.
Олег Витка, гендиректор ООО "Западно-Малобалыкское" (СП ЮКОСа и венгерской MOL). 1 июля 2005 года приговорен Нефтеюганским горсудом к 3,5 года лишения свободы условно по ст. 171 (незаконное предпринимательство). Прокуратура требовала приговорить его к 3 годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии-поселении и к выплате штрафа в 100 тыс. руб.
Тагирзян Гильманов, депутат думы ХМАО, экс-управляющий директор ОАО "Юганскнефтегаз", управляющий ЮКОС-РМ. Обвиняется по ст. 33 ч. 5 (пособничество в совершении преступления) и по ст. 199 ч. 2 (уклонение от уплаты налогов по предварительному сговору и в особо крупных размерах). Гособвинитель требовал назначить ему наказание в виде трех лет лишения свободы, однако 14 июля 2005 года Нефтеюганский райсуд оправдал Тагирзяна Гильманова за отсутствием состава преступления. В августе 2005 года коллегия окружного суда ХМАО отменила приговор, направив дело на новое рассмотрение. В настоящее время господин Гильманов находится под подпиской о невыезде.