Родился 25 ноября 1953 года в селе Черемхово Ивановского района Амурской области в семье военнослужащего.
В 1975 году окончил Дальневосточное высшее общевойсковое командное училище им. К. К. Рокоссовского, в 1986 году — Общевойсковую академию им. М. В. Фрунзе, в 1995 году — Академию Генштаба.
С 1975 года служил в Прикарпатском военном округе: командир взвода, роты, батальона. В 1986-1993 годах — начштаба и командир полка, начштаба дивизии Забайкальского военного округа. С 1995 года командир 18-й гвардейской Инстербургской мотострелковой дивизии (Черняховск, Калининградская область). С января 1998 года — начштаба, со 2 декабря 1999 года — командующий сухопутными и береговыми войсками Балтийского флота.
17 сентября 2001 года назначен начштаба — первым замкомандующего войсками Сибирского военного округа (Чита). В январе 2004 года фамилия генерала Бакина упоминалась в числе лиц, ответственных за обморожение группы призывников, следовавших из Подмосковья через Новосибирск в Магадан, в результате чего один человек скончался. Был допрошен в качестве свидетеля по этому делу. Главный военный прокурор Александр Савенков тогда заявил, что Владимир Бакин "не выполнил требований начальника Генштаба о создании при аэропортах транзитных коридоров и пунктов приема и размещения личного состава". Однако никаких последствий для генерала это не повлекло, и 5 января 2005 года он был назначен на должность начальника штаба — первым заместителем командующего войсками Приволжско-Уральского военного округа (Екатеринбург).
Награжден орденами "За военные заслуги", "За службу Родине в Вооруженных Силах СССР" III степени, 15 медалями.
Женат, имеет сына и дочь.