Согласно решению суда, Михаил Ходорковский должен быть направлен в исправительную колонию общего режима, где отбывают наказание лица, осужденные впервые, совершившие преступления небольшой или средней тяжести и не являющиеся рецидивистами. По прибытии в зону заключенный Ходорковский попадет в отряд с обычными условиями содержания: заключенные живут в общежитиях, похожих на обычные казармы, и могут свободно перемещаться внутри помещения, соблюдая распорядок дня. Ежемесячные расходы ограничены тремя МРОТ (2160 руб.) За год можно получить шесть посылок, шесть бандеролей, шесть краткосрочных (четыре часа) и четыре длительных свидания (трое суток). С разрешения администрации можно вести телефонные разговоры (не более 15 минут каждый).
За хорошее поведение заключенного Ходорковского через шесть месяцев могут перевести в отряд с облегченными условиями. Здесь можно тратить деньги без ограничений, получать в два раза больше посылок и бандеролей, иметь шесть длительных свиданий. По отбытии одной четверти срока заключенного могут перевести в колонию-поселение. По отбытии половины срока он может ходатайствовать об условно-досрочном освобождении. Кроме того, за полгода до окончания срока ему могут разрешить жить за пределами колонии.
За нарушения порядка можно попасть в отряд со строгими условиями отбывания наказания: проживание "в запираемых помещениях", прогулка 1,5 часа, разрешено тратить только деньги, заработанные в колонии. В год можно получить три посылки, три бандероли, два коротких и два длительных свидания.
Как профессиональный менеджер, Михаил Ходорковский, скорее всего, займется административной работой, заняв пост нарядчика, диспетчера производства, заведующего клубом, библиотекой. Его зарплата составит 700-1500 руб. Формально заключенный может с разрешения начальника колонии заниматься бизнесом (в форме индивидуальной трудовой деятельности или создания ООО). В действительности это не практикуется. В лучшем случае можно попасть на участок "ширпотреба", где заключенные пишут картины, режут по дереву, плетут мебель, ремонтируют автомобили.
За хорошее поведение заключенный может получить: благодарность, подарок, премию, дополнительную посылку или свидание; разрешение дополнительно расходовать деньги в сумме до одной четверти МРОТ (180 руб.) Осужденный может рассчитывать на краткосрочный (семь суток) отпуск "в связи с исключительными личными обстоятельствами" или ежегодный отпуск продолжительностью 28 дней.
За нарушения порядка к заключенному могут применить взыскания: выговор, штраф до 200 руб., водворение в штрафной изолятор, перевод в помещение камерного типа, перевод в тюрьму.
Большинство колоний общего режима — "красные". Здесь жизнь заключенного жестко контролируется администрацией, активно работает аппарат осведомителей. Невозможно купить водку, наркотики, получить неположенную передачу или свидание, устроить игру в карты. Для получения льгот осужденный должен вступить в самодеятельную организацию (например, секцию дисциплины и порядка) и "твердо встать на путь исправления".
"Черные" зоны находятся под неформальным воровским контролем. Режимные мероприятия (например, обыски) проводятся администрацией формально. Можно не работать, существует возможность бесконтрольно поговорить по мобильному телефону, купить алкоголь и т. д.