12 января 1993 года Юрий Шафраник, возглавлявший администрацию Тюменской области с октября 1991 года, назначен указом президента Бориса Ельцина министром топлива и энергетики РФ.
16 мая 1994 года глава администрации Краснодарского края Николай Егоров, занимавший этот пост с декабря 1992 года, назначен министром по делам национальностей и региональной политики.
17 марта 1997 года губернатор Нижегородской области Борис Немцов, руководивший областью с декабря 1991 года, назначен вице-премьером правительства России.
1 июля 1997 года губернатор Кемеровской области Михаил Кислюк, руководивший регионом с августа 1991 года, назначен руководителем Федеральной службы по регулированию естественных монополий на транспорте. В тот же день кемеровским губернатором назначен министр по делам СНГ Аман Тулеев. По данным СМИ, причиной "рокировки" стала невысокая популярность Михаила Кислюка в регионе накануне выборов 19 октября 1997 года. В результате выборы выиграл Аман Тулеев, набравший 95% голосов.
18 сентября 1998 года губернатор Ленинградской области Вадим Густов, возглавлявший область с сентября 1996 года, назначен первым вице-премьером правительства РФ.
5 февраля 2001 года губернатор Приморского края Евгений Наздратенко, руководивший регионом с мая 1993 года, в телефонном разговоре с Владимиром Путиным сообщил президенту РФ о своем намерении уйти в отставку. У главы государства это намерение возражений не вызвало (месяцем раньше депутаты Приморской облдумы выразили губернатору недоверие). 24 февраля 2001 года Евгений Наздратенко назначен председателем Государственного комитета РФ по рыболовству.
16 июня 2003 года губернатор Санкт-Петербурга Владимир Яковлев, занимавший пост руководителя города с июня 1996 года, назначен вице-премьером правительства России.