17 июля 1990 года во время выхода в открытый космос на станции "Мир" космонавты Анатолий Соловьев и Александр Баландин повредили крышку выходного люка модуля "Квант-2". Для возвращения в станцию пришлось использовать приборно-научный отсек модуля. Люк был отремонтирован только 7 января 1991 года.
15 октября 1994 года на станции "Мир" произошел пожар: из бракованной твердотопливной шашки для получения кислорода вырвалось сильное пламя. Пожар потушил врач-космонавт Валерий Поляков, накрывший очаг возгорания комбинезоном.23 февраля 1997 года в модуле "Квант" станции "Мир" произошел пожар. Вновь воспламенилась кислородная твердотопливная шашка. Пожар потушил космонавт Валерий Корзун с помощью двух огнетушителей.
В марте 1997 года на станции "Мир" вышли из строя несколько контуров охлаждения. Температура внутри станции поднялась до +40°. К концу апреля работу системы терморегулирования восстановили космонавты Василий Циблиев и Александр Лазуткин.
25 июня 1997 года в модуль "Спектр" станции "Мир" врезался грузовой корабль "Прогресс М-34", дистанционно управляемый Василием Циблиевым. От полной разгерметизации станцию спасли Александр Лазуткин и Майкл Фоул, вовремя задраившие люк в пробитый "Спектр".
5 июня 1999 года на станции "Мир" была обнаружена утечка атмосферы со скоростью около 1,5 мм рт. ст. в сутки. Место утечки (негерметичный датчик давления) обнаружили 19 апреля 2000 года Сергей Залетин и Александр Калери. Вместо датчика была установлена герметичная заглушка.