За последние два года усилиями Генпрокуратуры и следственного комитета МВД Владимир Яковлев лишился большей части своей команды. Два вице-губернатора — Валерий Малышев (транспорт и спорт) и Анатолий Каган (комитет по здравоохранению) — были отстранены от должности Генпрокуратурой в рамках возбужденных в отношении их уголовных дел. Александр Потехин (комитет по печати и СМИ) ушел в отставку сам после возбуждения против него уголовного дела. Еще один вице-губернатор, Виктор Кротов (комитет финансов), пока работает, хотя Генпрокуратура и возбудила в отношении него уголовное дело. Наконец, еще двое питерских вице-губернаторов, Виктор Яцуба (руководитель канцелярии) и Юрий Антонов (руководил канцелярией после Яцубы, также курировал инвестиции и ТЭК), под давлением компромата ушли с государственной службы и сейчас работают в частных структурах. Последним под следствие попал руководитель комитета по физкультуре и спорту администрации Петербурга Валентин Меттус. Его подозревают в лоббировании интересов фирмы-посредника, получившей подряд на реконструкцию одного из городских физкультурно-оздоровительных комплексов.
