Родился 8 июня 1967 года в городе Шахунья Горьковской области.
В 1990 году окончил Ленинградский институт точной механики и оптики по специальности инженер-оптик-исследователь.
Трудовую деятельность начал в 1997 году – в ОАО «ИНКОМБАНК» на должности начальника управления стратегическими проектами.
С 1999 года – начальник управления по работе с клиентами ОАО «БалтОНЭКСИМ».
С 2000 года – вице-президент ОАО «Межрегиональный клиринговый банк».
С 2001 года – вице-президент, заместитель начальника управления ОАО «Альфа-Банк».
С 2006 года – директор по железнодорожному бизнесу ОАО «Русские машины».
С 2009 года – директор по развитию крупного корпоративного бизнеса ОАО «Альфа –Банк»;
С 2010 года – исполнительный директор ЗАО «Интегрированные транспортные системы».
Вместе с тем был назначен Председателем Совета директоров ОАО «Абаканвагонмаш», ОАО «Русская корпорация транспортного машиностроения», входил в состав Совета директоров группы компаний S7, авиакомпании «Сибирь», а так же – Ассоциации независимых директоров.
В годы профессионального становления окончил курсы:
• Оценка инвестиционных проектов (TASIS, Санкт-Петербург)
• Эффективные продажи (Санкт-Петербург)
• Корпоративный университет Альфа-Банка (Москва)
• Лидерство в управлении (Москва)
• Производственная система (НН, Москва)
С 2011 года по настоящее время – первый заместитель генерального директора ОАО «МКЖД».
Алексей Зотов в рамках Проекта по реконструкции и развитию Малого кольца Московской железной дороги осуществляет оперативное управление деятельностью ОАО «МКЖД», организовывает эффективное взаимодействие Общества с органами власти Российской Федерации и города Москвы, а также координирует работу по повышению инвестиционной привлекательности Проекта как на отечественном, так и на международном уровнях.
Женат. Имеет двух сыновей.