Гайдар Мария Егоровна родилась 21 октября 1982 года в Москве в семье экономиста Егора Гайдара. В 2005 году окончила факультет экономических и социальных наук Академии народного хозяйства при правительстве, в 2014 году — Московскую государственную юридическую академию.
В 2002–2004 годах работала экспертом в компании «Видео Интернешнл». В 2004–2008 годах — младший научный сотрудник в фонде Института экономики переходного периода, который возглавлял Егор Гайдар. Также преподавала экономику в спецшколе №1252 в Москве. С 2005 года — член СПС, тогда же с Алексеем Навальным и Натальей Морарь создала молодежное движение «ДА!» («Демократическая альтернатива»). С 2005 года — президент Фонда поддержки молодежных программ. Тогда же стала одним из создателей инициативной группы «Я свободен!», выступавших за свободу СМИ, за переход армии на контрактную основу, против фашизма. Кроме того, в 2005 году получила предложение баллотироваться в Мосгордуму от СПС, но отклонила его. Тогда же выдвигалась на довыборы в Госдуму, но сняла свою кандидатуру в пользу Виктора Шендеровича.
В 2006–2008 годах — активная участница «маршей несогласных» и других акций оппозиции. В 2007 году на выборах в Госдуму возглавляла московский избирательный список СПС. С декабря 2007 года — член федерального политсовета партии, с 2008 года — член президиума. Активно выступила против ликвидации СПС. В 2008–2009 годах и с 2012 года — ведущая на радиостанции «Эхо Москвы». 18 февраля 2009 года назначена советником по социальным вопросам губернатора Кировской области Никиты Белых. 23 июля 2009 года заксобрание Кировской области утвердило ее на посту заместителя председателя правительства области по вопросам здравоохранения и социального развития.
В 2011–2012 годах училась в Гарвардском университете США, в Школе управления имени Джона Кеннеди. В декабре 2012-го — ноябре 2013 года занимала должность советника на общественных началах вице-мэра Москвы по социальным вопросам Леонида Печатникова. В 2013 году учредила фонд социальной помощи и поддержки населения «Социальный запрос», руководит фондом. В 2014 году выдвигалась кандидатом в депутаты Мосгордумы от оппозиционной коалиции «За Москву», но суд отказал в регистрации из-за недопустимого числа недействительных подписей. 27 октября 2014 года дома у Марии Гайдар прошли обыски в рамках дела о хищении средств у СПС.
Замужем, воспитывает дочь.