26 мая 2000 года к 55-й годовщине Победы Госдума начала амнистию, которая коснулась 877 тыс. человек. Из них из мест лишения свободы вышли 188 тыс.
30 октября 2001 года были амнистированы 10 тыс. подростков и 14 тыс. женщин, осужденных за нетяжкие преступления.
6 июня 2003 года была объявлена амнистия для участников конфликта в Чечне в связи с принятием конституции республики. Ею воспользовались 171 боевик и 226 военных и милиционеров.
20 апреля 2005 года по случаю 60-летия Победы были освобождены 217 человек — 55 ветеранов ВОВ, 112 тружеников тыла, 30 блокадников и 20 узников лагерей.
19 апреля 2006 года в честь столетия Госдумы были амнистированы 14 тыс. несовершеннолетних, женщин с детьми, беременных и пенсионеров, не совершивших тяжких преступлений.
22 сентября 2006 года стартовала очередная амнистия для участников конфликта на Кавказе. Оружие сложили 546 боевиков.
16 апреля 2010 года Госдума объявила амнистию по случаю 65-летия Победы для участников ВОВ, тружеников тыла и жителей блокадного Ленинграда. Она коснулась 200-250 человек.
2 июля 2013 года Госдума начала амнистию для граждан, осужденных или привлеченных по 27 статьям УК РФ, предусматривающим наказание за экономические преступления. По ней на свободу вышли около 2,5 тыс. человек.
18 декабря 2013 года Госдума одобрила президентский проект амнистии к 20-летию Конституции. По данным Генпрокуратуры, почти из 71 тыс. человек, попавших под амнистию, 21,5 тыс.— подростки.