В 1990-х годах различные казачьи общественные организации и их руководители активно участвовали в политических процессах в рамках различных избирательных блоков. Осенью 1993 года Союз казаков вместе с Конгрессом русских общин, Союзом нефтепромышленников и Социалистической партией трудящихся выступил учредителем избирательного блока "Отечество", который не набрал необходимых для регистрации подписей и в выборах не участвовал. Походный атаман Лабинского отдела Всекубанского казачьего войска Анатолий Долгополов избрался в Госдуму по одномандатному округу. В 1995 году Союз казаков принял участие в думских выборах в составе блока "Наш дом — Россия", по его партийному списку прошел в состав Госдумы атаман Александр Мартынов. Ряд казачьих структур вошли в "Российское общенародное движение", не получившее на выборах ни одного мандата.
В июне 2000 года на заседании совета атаманов казачьих обществ России было принято решение о создании общественно-политического движения "Казаки России", однако инициатива реализована не была. В мае 2002 года в Самаре была учреждена одноименная народно-патриотическая партия казачьего самоуправления. Минюст отказал ей в регистрации из-за нарушений в уставе. В 2004 году анонсировалось проведение учредительного съезда Единой партии казаков и патриотов России, но больше о ней ничего не сообщалось. В июне 2006 года войсковой атаман Волжского казачьего войска Борис Гусев призвал казаков вступать в ряды партии власти и работать с "Единой Россией", поскольку, по его мнению, момент для создания казачьей партии "упущен".
После либерализации партийного законодательства в 2012 году появились новые инициативы по созданию казачьих партий. В настоящее время в Минюсте помимо Казачьей партии РФ зарегистрированы оргкомитеты следующих партийных организаций: народной казачьей консолидации противодействия чиновникам, нарушающим законы, Конституцию и природные права казаков на самоорганизацию и самоуправление "Союз казачьих формирований Российской Федерации", всероссийской политической партии "Казачья политическая партия", казачьей народной политической партии "Российская социально-экологическая держава", "Братья Казаки", казачьей партии "Свободная Русь", всероссийской партии "Казаки России", политической партии "Казаки России".