Прогноз Александра Конаныхина оказался верным. После его увольнения Всероссийский биржевой банк просуществовал недолго. Но в крахе ВББ руководители банка винят прежде всего самого Конаныхина. Уходя из ВББ, он прихватил с собой более $8 млн. ВББ обанкротился. Уже в 1994 году Главная военная прокуратура (ГВП) России возбудила против Конаныхина уголовное дело.
Распорядиться вывезенными капиталами Конаныхин не смог. Часть денег удалось арестовать, а вложения в European Union Bank, который был учрежден Конаныхиным на острове Антигуа, себя не оправдали.
Летом 1996 года агенты Федеральной службы иммиграции и натурализации (INS) США арестовали Конаныхина, обвинив его в нарушении иммиграционных правил. ГВП пыталась добиться выдачи банкира, но американцы не пошли ей навстречу. Между Америкой и Россией до сих пор не заключен договор об экстрадиции преступников. В иммиграционной тюрьме глава ВББ провел около года, но его адвокатам удалось добиться изменения меры пресечения. Конаныхина перевели под домашний арест. На его ногу был надет браслет с электронным датчиком, который сработал бы, если бы он покинул Вашингтон. Чуть позже, по решению суда, датчик, а вместе с ним и все обвинения с Конаныхина были сняты. В Россию Конаныхин возвращаться пока не собирается — военная прокуратура не закрыла его уголовное дело и до сих пор пытается добиться выдачи банкира.