Высота цунами в некоторых местах японского побережья достигала 15-20 метров. Ученые японского Института по изучению состояния гидротехнических сооружений определили, что высота цунами в городе Онагава на побережье Санрику северо-востока острова Хонсю (префектура Мияги) превысила 15 метров. Определить высоту волны помогли нанесенные водой груды обломков, скопившиеся на крыше одного из трехэтажных зданий. В городе Рикудзэнтаката (префектура Иватэ) высота волн достигала 20 метров. В этом случае ученые основывались на анализе фотосъемок с воздуха.
Исторический максимум цунами в Японии был зафиксирован в 1896 году, когда город-порт Офунато, расположенный на побережье Санрику в префектуре Иватэ, оказался разрушен цунами высотой 38,2 метра.