Родился в 1957 году в Москве. В 1979 году окончил экономический факультет МГУ. С 1989 года работал в Институте экономики АН СССР, тогда же создал вместе с группой преподавателей, научных сотрудников и аспирантов МГУ и ИЭ АН СССР "альтернативную" кафедру экономической теории в Физико-техническом институте. В 1992 году вместе с Евгением Ясиным предложил правительству концепцию создания Высшей школы экономики. С 1999 года — член совета Центра стратегических разработок. Под руководством Ярослава Кузьминова и министра образования Владимира Филиппова подготовлен раздел "Модернизация образования" программы правительства РФ. Участвовал в подготовке экономической программы, представленной Госсоветом России в 2001 году ("программа Ишаева"). В 2001 году активно участвовал в разработке ФЦП "Электронная Россия". В 2002-2003 годах вместе с Александром Яковлевым работал над концепцией развития "новой экономики". Член комиссии при президенте по вопросам реформирования и развития госслужбы, совета при президенте по содействию развитию институтов гражданского общества и правам человека, правительственных комиссий по проведению административной реформы и по оценке результативности деятельности органов исполнительной власти.