11 июня 1996 года при взрыве в вагоне между станциями "Тульская" и "Нагатинская" погибли четыре человека. Вскоре, по словам начальника подземки Дмитрия Гаева, метрополитен получил для защиты от террористов 56 собак, "собранных со всей Центральной России".
6 февраля 2004 года террорист-смертник взорвал бомбу в вагоне между станциями "Автозаводская" и "Павелецкая", погиб 41 человек. Через месяц господин Гаев сообщил о начале реализации программы повышения безопасности, включающей установку за полтора-два года камер слежения во всех 4500 вагонах. На проект из госбюджета планировалось выделить 2,5 млрд руб. Тогда же господин Гаев говорил, что сам метрополитен тратит на безопасность 1 млрд руб. ежегодно. В 2009 году МВД отмечало, что камерами оснащены только 469 вагонов.
В сентябре 2005 года Дмитрий Гаев сообщил о планах за два с половиной года оснастить станции металлоискателями и газоанализаторами взрывчатых веществ. До 2010 года о работах по их установке ничего не сообщалось.
29 марта 2010 года на станциях "Лубянка" и "Парк культуры" прогремели новые взрывы, унесшие жизни 40 человек. 31 марта президент Дмитрий Медведев подписал указ о создании комплексной системы безопасности на транспорте. В июле правительство утвердило соответствующую программу, предусматривающую выделение на безопасность метро 12 млрд руб. в течение трех лет. Программа, в частности, предполагает монтаж у входов на станции метро систем видеонаблюдения, рентгеновских установок и обнаружителей паров взрывчатых веществ.
Между тем через три дня после теракта Дмитрий Гаев заявил, что метро нужны "патрульно-постовая служба и как минимум 300-400 собак", а не "мифические компьютерные системы". 27 января 2011 года со слов мэра Москвы Сергея Собянина выяснилось, что кинологов с собаками в столичном метро по-прежнему "40 единиц".