В 2008 году на основании материалов, поступивших из правительства РФ и администрации президента, а также данных еженедельного мониторинга розничных и оптовых цен на нефтепродукты территориальных УФАС были возбуждены дела в отношении ряда вертикально интегрированных нефтяных компаний, в том числе в отношении структур ЛУКОЙЛа. 27 октября 2008 года антимонопольное ведомство признало ЛУКОЙЛ и четыре его НПЗ злоупотребившими доминирующим положением на рынке за счет установления, поддержания монопольно высоких оптовых цен на нефтепродукты в стране. Компания попыталась обжаловать это решение в суде. Иски ЛУКОЙЛа и ее четырех «дочек» рассматривались отдельно. При этом дела «дочек» были отложены до принятия решения по иску головной компании. В июне 2009 года арбитражный суд Москвы подтвердил законность решения и предписания ФАС в отношении ЛУКОЙЛа, а 28 декабря 2009 года при рассмотрении дела в апелляционной инстанции компания отозвала свои исковые требования.