Виктор Алексеевич Зубков родился 15 сентября 1941 года в поселке Арбат Кушвинского района Свердловской области.
В 1965 году окончил экономический факультет Ленинградского сельскохозяйственного института.
Кандидат экономических наук.
Трудовую деятельность начал в городе Мончегорск в 1958 году слесарем на ремонтно-механическом заводе, затем на руднике комбината "Североникель".
В 1967 - 1970 годах - управляющий отделением, заместитель директора совхоза "Красная Славянка", Гатчинский район Ленинградской области.
В 1970 - 1982 годах - директор племенного совхоза "Раздолье", Ленинградская область.
В 1982 - 1985 годах - генеральный директор объединения совхоза "Первомайское", Приозерский район Ленинградской области.
В 1985 - 1986 годах - председатель Приозерского горисполкома.
В 1986 - 1987 годах - первый секретарь Приозерского горкома КПСС.
В 1987 - 1989 годах - заведующий отделом сельского хозяйства и пищевой промышленности Ленинградского обкома КПСС.
В 1989 - 1991 годах - первый заместитель председателя Леноблисполкома.
В 1991 - 1993 годах - заместитель председателя Комитета внешних связей мэрии Санкт-Петербурга.
В 1993 - 1998 годах - заместитель руководителя налоговой службы Российской Федерации - начальник Санкт-Петербургской налоговой инспекции.
В 1998 - 1999 годах - начальник управления министерства Российской Федерации по налогам и сборам по Санкт-Петербургу.
В 1999 - 2001 годах - заместитель министра Российской Федерации по налогам и сборам.
В 2001 году - первый заместитель министра финансов Российской Федерации.
В 2001 - 2004 годах - председатель Комитета Российской Федерации по финансовому мониторингу.
С 16 марта 2004 года - руководитель Федеральной службы по финансовому мониторингу (Росфинмониторинг).
Государственный советник налоговой службы первого ранга. Награжден орденами Трудового Красного Знамени, "Знак Почета", "За заслуги перед Отечеством". Заслуженный экономист Российской Федерации.
Женат, имеет дочь.