Запуск программы дополнительного лекарственного обеспечения (ДЛО) в начале 2005 года сопровождался многочисленными сбоями в поставках лекарств. Это вызвало резкую критику со стороны госчиновников и простых граждан. Уже 14 февраля 2005 года премьер Михаил Фрадков раскритиковал Минздравсоцразвития за возникшие проблемы с запуском программы. Красноярский губернатор Александр Хлопонин, возмущенный перебоями с лекарствами, заявил, что "Зурабов должен ответить за этот бардак!". В ряде регионов прошли митинги протеста льготников.
В ноябре 2006 года арестован директор Федерального фонда обязательного медицинского страхования Андрей Таранов и ряд его подчиненных. Генпрокуратура обвинила их в нецелевом использовании бюджетных средств и получении взяток за включение частных фирм в программу дополнительного лекарственного обеспечения граждан. Обыски прошли и в ряде дистрибуторских компаний, участвовавших в программе ДЛО.
К концу 2006 года выяснилось, что фармдистрибуторы поставили льготникам лекарств на общую сумму 70 млрд руб. при бюджете программы ДЛО в 29 млрд руб. Государство вернуло фармкомпаниям лишь половину долга — около 20 млрд руб., а остальное глава Минздравсоцразвития Михаил Зурабов предложил списать на убытки фармкомпаний. В ответ поставщики сократили объемы поставок в региональные аптеки, а ряд компаний заявили о возможности своего выхода из ДЛО. В итоге в марте 2007 года был уволен отвечавший за программу глава Росздравнадзора Рамил Хабриев.