Летом 1996 года в структуре Банка России было создано специальное операционное управление по надзору за крупнейшими банками (ОПЕРУ-2) во главе с зампредом ЦБ Денисом Киселевым. В новую структуру попали на обслуживание 14 крупнейших российских банков, сосредоточивших около 2/3 совокупных активов банковской системы и 90% вкладов граждан. Банкам при этом гарантировалась поддержка со стороны государства, а сами они назывались "непотопляемыми". Вместе с тем в момент кризиса системообразующие банки "просели" гораздо больше других кредитных организаций. Так, их собственный капитал уже к ноябрю 1998 года снизился на 73% при общем показателе для банковской системы 39%. Несмотря на предоставленные ЦБ стабилизационные кредиты почти на 15 млрд рублей, большинство системообразующих банков утратили свое лидерство или обанкротились. В сентябре 1998 года, после назначения председателем ЦБ Виктора Геращенко, структура ОПЕРУ-2 была слита с московским главком ЦБ.