30 марта 2002 года на съезде в Москве "Либеральная Россия" преобразована в политическую партию. Ее сопредседателями избраны Сергей Юшенков, Борис Березовский, Виктор Похмелкин, Владимир Головлев и Борис Золотухин.
11 июля 2002 года Министерство юстиции отказалось зарегистрировать "Либеральную Россию", сославшись на несоответствие ее устава закону "О политических партиях".4 октября 2002 года депутат Юшенков объявил, что партия разрывает все отношения с Борисом Березовским. Причиной послужили заявления последнего, "свидетельствующие о симпатии к коммунистам" и о намерении сотрудничать с ними ради создания широкой антипрезидентской оппозиции.
9 октября 2002 года политсовет "Либеральной России" исключил Бориса Березовского из партии.
22 октября 2002 года Минюст зарегистрировал "Либеральную Россию" в связи с внесением в ее устав требуемых изменений.
7 декабря 2002 года в Санкт-Петербурге прошел экстренный съезд партии, инициированный рядом региональных отделений "Либеральной России". Делегаты восстановили в партии Бориса Березовского и лишили постов всех остальных сопредседателей. Накануне съезда сторонники Сергея Юшенкова исключили из партии инициаторов съезда, который назвали незаконным. На их сторону встал и Минюст: его представители заявили, что проведение съезда сторонниками господина Березовского незаконно и противоречит закону "О политических партиях".
11 мая 2003 года прошло заседание центрального совета партии, проведенного сторонниками Бориса Березовского. Они исключили из "Либеральной России" Виктора Похмелкина и секретаря политсовета Юлия Нисневича и снова избрали сопредседателем Бориса Березовского. Центральный совет также решил созвать внеочередной съезд "Либеральной России" 14 июня. В этот же день под руководством Виктора Похмелкина должно пройти заседание политсовета "Либеральной России", который собирается назначить дату и место проведения своего съезда. Таким образом, сейчас в рамках одной официально зарегистрированной партии существует две группы, каждая из которых считает свои решения законными и заявляет о нелегитимности действий противоборствующей стороны.