Премьер Виктор Черномырдин не видит "ничего особенного" в назначении Березовского. Он подчеркнул, что СБ "занимается выработкой предложений, а решения принимают президент и правительство". При этом Черномырдин заявил, что для повышения качества работы СБ необходимо "привлекать людей, занимающих высокое положение в бизнесе". По мнению премьера, "в России немало людей, которые активно следят за ситуацией в стране и реально могут что-то сделать полезное". Он выразил сомнение в том, что за Березовским будет закреплено кураторство вопросов экономической безопасности.
Спикер Думы Геннадий Селезнев выступил с протестом: "Человек, сделавший антироссийский информпереворот на первом канале телевидения, влезает в святая святых, в вопросы безопасности государства российского". Селезнев убежден, что "такое назначение не могло состояться без протекции Анатолия Чубайса". Спикер потребовал немедленного отстранения Чубайса от должности. При этом он "ничуть не сомневается, что выражает мнение абсолютного большинства россиян". Селезнева поддержал лидер КПРФ Геннадий Зюганов, заявив, что не знает, кто подписывал документ о назначении Березовского.
Секретарь СБ Иван Рыбкин считает нетактичным вмешательство в назначения в СБ, которые делает президент. Для него не было неожиданностью назначение двумя его заместителями Бориса Березовского и Леонида Майорова. Рыбкин также заявил, что назначение Березовского и Майорова "прошло все стадии согласования".
Лидер фракции "Яблоко" Григорий Явлинский: происходящее — "возмутительная некомпетентность со стороны президентских структур". По его словам, Березовский "никакого отношения к СБ не имеет", и лидер "Яблока" может только догадываться, "какие другие назначения делает Чубайс". Во всяком случае "назначения соответствуют взглядам Чубайса, но никак не соответствует интересам страны". По мнению Явлинского, "такие назначения дискредитируют президента".
Один из судей Конституционного суда оценил назначение Березовского с точки зрения соответствия его нынешнего положения Конституции: получив назначение в СБ, Березовский обязан прекратить всю коммерческую деятельность. К этому его обязывают законы "О государственной службе", "Об антимонопольной деятельности", а также указы президента.
Заместитель председателя фракции НДР Госдумы Роман Попкович: назначение Березовского в СБ "идет вразрез с последним радиообращением президента России Бориса Ельцина, в котором содержался призыв к согласию". Он считает, что перед назначением "необходимо было всем доказать, что это именно тот человек, без которого СБ не может обойтись".
Заместитель секретаря СБ Борис Березовский готов прекратить любую коммерческую деятельность в связи с назначением его заместителем секретаря СБ: "Я буду выполнять все правовые нормы действующего законодательства, которые накладывают определенные обязательства на всех, кто поступает на государственную службу".