Российский фонд федерального имущества распоряжается госпакетами акций более чем 3 тысяч российских предприятий. Наряду с Мингосимущества, РФФИ может от лица РФ выступать в качестве учредителя акционерных обществ с государственным участием. Фонд может передавать их акции Мингосимуществу и получать от него другие, продавать и вносить их в уставные капиталы компаний. Такие полномочия РФФИ получил потому, что Гражданский кодекс запрещает органам исполнительной власти выступать учредителями и участниками акционерных обществ.
Сейчас РФФИ является учредителем и акционером таких компаний, как "Аэрофлот--Российские международные авиалинии", РАО "ВСМ", ОАО "Интерагрофонд", ОАО "Федеральная фондовая корпорация", Российский банк реконструкции и развития, Всероссийский банк развития регионов, Росэксимбанк, ОАО "Трехмерная память", Российский банк развития, Банк развития предпринимательства и др. Кроме того, РФФИ учредил и до недавнего времени владел 100% Агентства по реструктуризации кредитных организаций (в связи с тем, что в июле этого года АРКО была преобразовано в госкорпорацию, РФФИ перестал быть его акционером.) В ближайшее время фонд выступит учредителем ОАО "Камавтодизель", МАК "Ильюшин", ОАО "Корпорация 'Аэрокосмическое оборудование'", ОАО "Машиностроительная корпорация" и других компаний.