— Гробы из Санкт-Петербурга доставляются 15 июля в 14.00. Останки каждого каждого конкретного лица в присутствии членов комиссии по идентификации останков, сотрудников Генпрокуратуры РФ, Генпрокуратуры Свердловской области, траурной службы помещаются в отдельный гроб. Гробы пломбируются, после чего комиссии подписывают протокол с указанием места, времени начала и окончания процедуры.
— Гробы с останками и протокол передаются церемонимейстеру, который сопровождает останки на протяжении всего пути от Екатеринбурга до Санкт-Петербурга. Погрузка гробов в автокатафалки осуществляется в порядке, определенном Государственной герольдией РФ. При выносе гробов с останками императрицы Александры Федоровны и императора Николая II офицеры почетного караула накрывают их императорскими штандартами, которые находятся на гробах до момента погребения. Сформированный траурный кортеж направляется к храму Вознесения Господня на Комсомольской площади Екатеринбурга.
— При подъезде кортежа к Вознесенскому храму начинается колокольный звон. Он прекращается только при внесении в собор всех гробов. Последним вносится гроб императора Николая II. Гробы переносятся офицерами почетного караула на постаменты.
— В 17.00 начинается служение заупокойной всенощной. По ее окончании участники похоронной церемонии покидают храм. Двери храма закрываются духовенством. Доступ в собор прекращается. Караулы у дверей храма остаются до следующего дня.
— Дома по маршруту следования траурной процессии от бюро судебной экспертизы до Комсомольской площади украшены государственными флагами РФ с траурными лентами и флагами Свердловской области с траурными лентами.
— 16 июля в 11.00 производятся три одиночных выстрела. Духовенство начинает служить панихиду. По окончании панихиды гробы с останками переносятся в автокатафалки в том же порядке, в каком были внесены в храм. Траурный кортеж направляется в аэропорт.
— Самолет с останками в сопровождении сотрудников траурной службы, Государственной герольдии, службы государственного протокола, рабочей группы и официальных лиц в 14.00 вылетает в Санкт-Петербург.
— Гробы с останками императора Николая II, членов его семьи и слуг прибудут из Екатеринбурга в аэропорт Пулково специальным рейсом 16 июля 1998 года в 14.00.
— После остановки самолета с останками к нему подается трап, от которого разворачивается ковровая дорожка длиной 20-30 метров. Справа от трапа в четыре шеренги встают 36 старших офицеров вооруженных сил и рота почетного караула. Слева — официальные лица, рядом с ними — журналисты. На расстоянии 50 метров от самолета встает военный оркестр.
— Сотрудники траурной службы выгружают гробы и передают каждый из них четырем офицерам, вышедшим из строя справа от трапа. Офицеры несут гроб к специальной автомашине. Барабанщики и флейтисты оркестра в момент выноса первого гроба начинают играть похоронный марш, предусмотренный строевым уставом 1908 года, и продолжают играть его без перерыва до того момента, как будет отъезжать катафалк с гробом великой княжны Ольги, а на трап вынесут гроб с останками императрицы Александры Федоровны.
— В момент появления гроба с останками императрицы Александры Федоровны на трапе самолета оркестр начинает исполнять "Коль славен" и продолжает играть до отъезда автокатафалка с останками императора Николая II.
— После отъезда автокатафалка с гробом императора Николая II церемония заканчивается. Ее участники, рота почетного караула, журналисты направляются к автобусам и автомашинам и рассаживаются в них.
— Вдоль трассы на протяжении Адмиралтейской и Дворцовой набережных от Медного всадника до Троицкого моста стоят в парадной форме слушатели военных академий и курсанты военных училищ Санкт-Петербурга со знаменами с траурными лентами, офицеры и барабанщики.
— При въезде кортежа на Троицкую площадь начинает звонить колокольня собора Св. Петра и Павла Петропавловской крепости. Звон прекращается только при внесении в собор гроба императора Николая II.
— Кортеж останавливается на Троицкой площади, автокатафалки останавливаются у Иоанновского моста Петропавловской крепости. Иоанновский мост украшен гирляндами из кипариса и листьями иммортелей. Все ворота Петропавловской крепости украшены государственными флагами РФ с траурными лентами и городскими флагами Санкт-Петербурга с траурными лентами. Доступ посторонних в Петропавловскую крепость прекращается.
— На Иоанновском мосту останки императора, членов его семьи и слуг встречает духовенство.
— Кортеж останавливается; происходит вынос гробов. Рота почетного караула выстраивается на Иоанновском мосту позади духовенства. Офицеры в четыре шеренги выстраиваются по набережной Кронверкского протока. Участники похоронной церемонии занимают места на Иоанновском мосту. Официальные лица, родственники, гости и журналисты становятся в отведенном для них месте.
— После прибытия участников церемонии духовенство начинает петь "Святый Боже". Офицеры начинают выносить гробы из автокатафалков.
— Траурная процессия в установленном порядке направляется в Петропавловскую крепость и двигается к собору Св. Петра и Павла. Двери собора открыты. У них выставлен парадный караул. В соборе приготовлены постаменты для девяти гробов.
— При входе на Петровскую площадь рота почетного караула останавливается напротив дверей собора. Процессия входит в собор. В 17.00 рота почетного караула покидает Петровскую площадь. Остаются только часовые, которые стоят парами.
— Офицеры поочередно устанавливают гробы на постаменты. После установки всех гробов к постаментам встает почетный караул. Духовенство с пением проходит за постаменты.
— В 17.00 начинается служение заупокойной всенощной. По окончании всенощной все официальные лица покидают собор. Двери собора закрываются духовенством. Священники выходят последними. Доступ в собор прекращается. Караул у постаментов с гробами и у собора остается до следующего дня, сменяясь каждый час.
— Погребение останков императора Николая II, членов его семьи и слуг будет произведено 17 июля 1998 года в приделе Св. Екатерины собора Св. Петра и Павла Петропавловской крепости.
— С 17.00 15 июля до 18.00 17 июля вход в Петропавловскую крепость будет разрешен только по специальным пропускам и извещениям о церемонии захоронения.
— В 11.00 17 июля откроется доступ в собор Св. Петра и Павла Петропавловской крепости. Колокольный звон начинается в 11.00 и заканчивается в 12.00.
— В 12.00 производятся три одиночных орудийных выстрела. Духовенство начинает служить заупокойную панихиду. Офицерами почетного караула снимаются императорские штандарты с гробов императрицы Александры Федоровны и императора Николая II. По окончании панихиды гробы с останками переносятся в придел Св. Екатерины. Каждый гроб берут четыре старшие офицера, переносят его к приделу и передают сотрудникам траурной службы, которые опускают гроб в место захоронения. В момент опускания гроба императора Николая II орудийной батареей производится салют из 19 залпов.
— После окончания салюта участники церемонии под духовное пение проходят вдоль захоронения и символически бросают в могилу щепотку "земли". Это может быть белый песок, насыпанный в чашу, стоящую на треножнике рядом с местом захоронения. Сверху захоронение закрывается плитами, рисунок которых определяется сотрудниками Государственной герольдии.
— Траурная процессия выходит из придела. Почетный караул располагается у входа в собор Св. Петра и Павла.
— Участники церемонии направляются на поминальную трапезу.