13 апреля 2004 года президент Владимир Путин подписал поручение "Об организации работ по строительству скоростной автодороги Москва--Санкт-Петербург".
5 апреля 2005 года мэр Химок Владимир Стрельченко утвердил план строительства участка скоростной платной автодороги Москва--Санкт-Петербург через Химкинский лес, для чего планировалось вырубить полосу длиной 8 км и шириной 6 км.
В начале 2007 года местные жители начали активную борьбу с проектом, в частности, обратившись в суды, к президенту и правительству.
В июне 2008 года Таганский суд Москвы признал строительство трассы законным. Тогда же началась вырубка деревьев, которая была сорвана экологами. 13 ноября был жестоко избит один из активистов, журналист Михаил Бекетов. 22 декабря господин Стрельченко отменил свое распоряжение о строительстве.
В июле 2009 года губернатор Московской области Борис Громов подписал постановление о сокращении полосы вырубки до 100 м. 5 ноября 2009 года выпущено распоряжение правительства России о передаче 150 га леса для строительства магистрали.
1 марта 2010 года Верховный суд подтвердил это распоряжение. 15 июля возобновилась вырубка просеки, которую вновь остановили экологи. 28 июля более 500 человек в знак протеста против трассы напали на здание администрации Химок. 22 августа в Москве на Пушкинской площади прошел трехтысячный митинг-концерт в защиту леса. 26 августа президент Дмитрий Медведев приказал приостановить вырубку и провести общественное обсуждение проблемы.
2 сентября в Химках прошли официальные слушания, которые экологи назвали "профанацией" и проигнорировали. Большинство участников этих слушаний высказались за продолжение стройки. 6 сентября в "Российской газете" вышла статья мэра Москвы Юрия Лужкова, поддержавшего маршрут через лес (позже эта статья называлась СМИ одной из причин отставки градоначальника). В тот же день на слушаниях "Единой России" определенной позиции выработано не было. 16 сентября Общественная палата также не смогла прийти к единому мнению, передав право окончательного решения "экспертам, которых выберет президент". 10 октября защитники леса сообщили, что, несмотря на распоряжение главы государства, вырубка продолжается. 12 октября Дмитрий Медведев провел в Кремле закрытое совещание с экспертами. 9 декабря Владимир Путин заявил, что окончательное решение будет принято после обнародования общего заключения Минтранса и Минприроды.