15 декабря 2000 года главный санитарный врач России Геннадий Онищенко издал постановление, которым обязал ужесточить контроль над производством пива, запретить его продажу лицам моложе 18 лет и ограничить крепость напитка 6%. 20 марта 2001 года постановление отменили.
В декабре 2004 года господин Онищенко заявил о вреде потребления энергетических напитков. 20 января 2005 года он подписал постановление об ограничении торговли энергетиками, запретив продажу слабоалкогольных энергетиков в ночных клубах.
В 2005 году главный санитарный врач инициировал проверку соответствия договоров о долевом строительстве закону о защите прав потребителей. По итогам проверки ряд компаний привлечены к административной ответственности и оштрафованы.
В конце марта 2006 года Геннадий Онищенко призвал Федеральную таможенную службу запретить ввоз в Россию вин из Грузии и Молдавии из-за их несоответствия российским стандартам качества. 27 марта 2006 года Росприроднадзор ввел запрет на вина и коньяки этих стран.
15 апреля 2006 года господин Онищенко заявил, что намерен "серьезно и целенаправленно" заняться контролем качества минеральной воды "Боржоми". С 5 мая 2006 года ведомство запретило ввоз, а с 7 мая — реализацию "Боржоми" в РФ.
В сентябре 2006 года главный санитарный врач выступил с инициативой запретить продажу вин, поставляемых из Китая, Белоруссии, Украины и Южной Америки. Запрет введен не был.
В мае 2008 Геннадий Онищенко предложил запретить переработку замороженного мяса, а 19 июня 2008 года запретил с 1 января 2009 года использовать для обработки мяса птицы растворы, содержащие хлор выше установленных требований.