Уголовное дело в отношении "Самаранефтегаза" было возбуждено в ноябре 2003 года, когда прокуратура Самарской области обвинила компанию в неуплате налогов в особо крупных размерах (ст. 199 ч. 2 УК РФ). По мнению прокуратуры, компания добывала практически чистую нефть, а платила налог с добычи нефтесодержащей жидкости, который значительно ниже. Обвинения по этому делу были предъявлены в феврале прошлого года управляющему "Самаранефтегаза" Павлу Анисимову и бывшему бухгалтеру компании Елене Марочкиной. Прокуратура считает, что именно их действия привели к тому, что компания недоплатила в 1999-2000 годах более 3,5 млрд руб. налогов.