Министерство промышленности и энергетики контролирует соблюдение соглашений о разделе продукции, структурной политики в области топливно-энергетического комплекса, рациональное использование и сбережение энергоресурсов.
Федеральная служба по финансовым рынкам проверяет компании в части, касающейся эмиссии ценных бумаг.Федеральная служба по экологическому, технологическому и атомному надзору проводит проверки в сфере безопасности ведения работ, связанных с пользованием недрами, соблюдения стандартов по охране недр.
Федеральная служба по тарифам выявляет нарушения в части соответствия установленным тарифам на транспортировку нефти и нефтепродуктов по магистральным трубопроводам.
Федеральная налоговая служба контролирует соблюдение налогового законодательства, правильность исчисления, полноту и своевременность уплаты налогов, сборов и других обязательных платежей в соответствующий бюджет и государственные внебюджетные фонды.
Федеральная антимонопольная служба контролирует соблюдение законодательства в сфере конкуренции на товарных рынках, защиты конкуренции на рынке финансовых услуг, деятельности субъектов естественных монополий (в части установленных полномочий), рекламы (в части установленных полномочий).
Федеральная служба по надзору в сфере природопользования проверяет деятельность на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
Федеральная служба по финансовому мониторингу осуществляет функции по противодействию легализации (отмыванию) доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма, а также координирует деятельность в этой сфере иных федеральных органов исполнительной власти.
Федеральная таможенная служба контролирует соблюдение таможенного законодательства.
Счетная палата проводит проверку осуществления компаниями налоговых отчислений в федеральный бюджет.