31 января 2000 года окружной избирком Калмыкии отменил итоги выборов в Госдуму от Калмыцкого одномандатного округа #14, прошедших 19 декабря 1999 года. По мнению избиркома, победившая на выборах кандидат от "Единства" Александра Буратаева неоднократно нарушила закон о выборах: с опозданием предоставила копии приказа об освобождении от обязанностей, не совместимых со статусом депутата, появилась в эфире ОРТ 31 декабря 1999 года, когда уже не имела права там работать. 4 февраля 2001 года ЦИК отменил решение местного избиркома и зарегистрировал Буратаеву депутатом Госдумы третьего созыва.
30 марта 2000 года Владивостокский окружной избирком отменил итоги довыборов в Госдуму по Владивостокскому одномандатному округу #50. В ходе голосования, прошедшего 26 марта 2000 года, большинство голосов набрал бывший мэр Владивостока Виктор Черепков. Однако избирком признал выборы недействительными на основании того, что в бюллетенях отсутствовала фамилия кандидата Орыси Бондаренко, лишенной регистрации за сутки до голосования за подкуп избирателей, но восстановленной в своих правах 29 марта Приморским крайсудом. 7 апреля 2000 года ЦИК отменил решение окризбиркома и признал избрание Виктора Черепкова.5 июля Самарский облсуд отменил итоги выборов в Госдуму по Промышленному одномандатному округу #152 (Самарская область), состоявшихся 19 декабря 1999 года. Тогда победу одержала член СПС Вера Лекарева. Ее основной конкурент генерал-полковник запаса, кандидат от КПРФ Альберт Макашов за четыре дня до голосования был лишен статуса кандидата (его уличили в том, что он расплачивался за агитационные материалы наличными деньгами). 15 февраля 2000 года Верховный суд признал незаконной аннулирование регистрации генерала Макашова. Во исполнение этого решения голосование было признано недействительным. Однако 29 августа Верховный суд признал выборы состоявшимися, посчитав, что нарушений в ходе голосования не было, а отмена регистрации Альберта Макашова не повлияла на волеизъявление избирателей.