Методика трансплантации фекальной микробиоты (так называемая «пересадка кала»), уже официально зарегистрированная в США и Великобритании, заключается в восстановлении нормальной кишечной микрофлоры у больного человека благодаря введению фекальной бактериальной микробиоты от здоровых доноров. Препараты донорского кала могут вводиться пациентам при помощи колоноскопа, клизмы, зонда или даже перорально в форме капсул, содержащих замороженные или высушенные фекальные микроорганизмы. «Трансплантация кала» успешно применяется, например, для лечения кишечной клостридиальной инфекции, превосходя по эффективности такой антибиотик, как ванкомицин, что особенно актуально на фоне широкого распространения явления бактериальной антибиотикорезистентности.