В 1994 году заместитель главы администрации Екатеринбурга Алексей Страхов указом президента Бориса Ельцина был назначен главой администрации Свердловской области — вместо отправленного в отставку за создание Уральской республики Эдуарда Росселя. Однако в 1995 году господин Россель победил на первых выборах губернатора и вновь возглавил исполнительную власть региона. Господин Страхов покинул Средний Урал.
В 1999 году на сторону областных властей перешел Александр Коберниченко, долгое время работавший вице-мэром Екатеринбурга по организационной и аналитической работе и руководивший аппаратом мэрии. Это произошло накануне выборов губернатора, в которых участвовал Эдуард Россель (победил) и мэр Екатеринбурга Аркадий Чернецкий (занял третье место). Господин Коберниченко занимал пост заместителя председателя областного правительства, позже он перешел на работу в администрацию губернатора. В 2004 году покинул органы власти.
В 2006 году председатель комитетов по товарному рынку и по организации бытового обслуживания населения Екатеринбурга Дмитрий Ноженко был назначен заместителем министра торговли, питания и услуг Свердловской области, а в 2009 году стал министром. С 2012 года возглавляет областное министерство экономики.
В феврале 2016 года вице-премьером областного правительства назначен заместитель главы администрации Екатеринбурга Александр Высокинский, которому поручено заняться разработкой проекта «Большой Екатеринбург». В кулуарах городской администрации его уход назвали предательством.
Случались и обратные перестановки: в 2011 году министр транспорта и дорожного хозяйства Свердловской области Сергей Швиндт стал первым заместителем главы администрации Екатеринбурга Александра Якоба. Наблюдатели, видевшие в нем человека, преданного губернатору Александру Мишарину, расценили это назначение как попытку администрации области усилить контроль над городскими властями. Однако, как показало время, господин Швиндт хорошо влился в коллектив и продолжил трудиться на благо Екатеринбурга и после ухода Александра Мишарина с поста губернатора.