Обозреватель «Новой газеты» Анна Политковская была застрелена 7 октября 2006 года в Москве. 27 августа 2007 года генпрокурор Юрий Чайка объявил об аресте 10 подозреваемых. Вскоре был задержан 11-й — экс-сотрудник столичного УБОПа Сергей Хаджикурбанов. Обвинения в итоге предъявили уроженцам Чечни братьям Ибрагиму и Джабраилу Махмудовым (по версии следствия, помогали убийце), господину Хаджикурбанову (организовал преступление) и подполковнику ФСБ Павлу Рягузову (достал адрес журналистки). По версии следствия, убийство было связано с профессиональной деятельностью журналистки.
29 марта 2008 года следствие назвало третьего брата Махмудова, Рустама, исполнителем убийства и объявило его в розыск. 17 ноября того же года в Московском окружном военном суде начался процесс по делу. В ходе прений обвинение заявляло о причастности к убийству чеченца Лом-Али Гайтукаева (дядя Махмудовых).
19 февраля обвиняемые были оправданы присяжными и освобождены из-под стражи. 2 апреля Сергей Хаджикурбанов был вновь задержан по обвинению в вымогательстве $350 тыс. у свидетеля Дмитрия Павлюченкова.
25 июня Военная коллегия Верховного суда по ходатайству Генпрокуратуры отменила оправдательный приговор из-за «многочисленных нарушений».
15 февраля 2010 года Таганский суд Москвы признал Хаджикурбанова виновным в вымогательстве и приговорил к восьми годам. 7 октября СКП предъявил ему новое обвинение в организации убийства, которое полностью повторяло первое.
31 мая 2011 года в Чечне был задержан Рустам Махмудов, 2 июня СКР предъявил ему обвинения. 23 августа по подозрению в организации убийства задержан и через три дня арестован Дмитрий Павлюченков. Он заключил сделку со следствием и назвал одним из заказчиков убийства бизнесмена Бориса Березовского. 28 октября обвинение в организации убийства было предъявлено Лом-Али Гайтукаеву. 14 декабря 2012 года Мосгорсуд приговорил Павлюченкова к 11 годам.
24 июля 2013 года в Мосгорсуде началось новое рассмотрение дела Гайтукаева, Махмудовых и Хаджикурбанова, но 14 ноября коллегия присяжных была распущена. 27 января 2014 года рассмотрение дела возобновилось.
20 мая 2014 года присяжные признали виновными всех фигурантов дела. Снисхождение, как решили народные заседатели, заслужил только один из подсудимых Ибрагим Махмудов, который, по версии СКР, следил за журналисткой.