Первая госпитальная школа на 50 учеников — новый вид высшего учебного заведения для подготовки врачей — была организована 21 ноября 1707 года при Московском сухопутном госпитале, что за Яузой. В 1733 году открываются аналогичные школы при адмиралтейских госпиталях в Санкт-Петербурге и в Кронштадте (на 10 подлекарей и 20 учеников в каждой), а немногим позже — при Колывано-Воскресенском заводском госпитале и при Елисаветградском госпитале.
В госпитальных школах преподавали врачи-иностранцы — на латыни, голландском и немецком языках, отчего слушатели набирались из числа учащихся Славяно-греко-латинской академии и школ духовного ведомства, где изучали греческий и латынь. Читались курсы по анатомии, физиологии, гистологии и судебной медицине, патанатомии, materia medica (фармакогнозии, минералогии, ботанике, фармации и фармакологии). При школах имелись собственные анатомические театры и аптекарские огороды. В 1764 году Медицинская коллегия разрешила преподавание и на русском, тогда же школы получили право присваивать врачам степень доктора медицины.
Когда же в 1786 году госпитальные школы преобразовали в медико-хирургические училища, к изучаемым предметам добавились химия, математика и физика. Обучение длилось до 7 лет и завершалось экзаменом, который помимо теоретической части включал в себя и практическую — проведение четырех операций в анатомическом театре.