31 декабря 2008 года НПФ "ТНК-Владимир" подал иск к управляющей компании "Пиоглобал Эссет Менеджмент". Фонд требовал возвращения 302,17 млн руб. убытков, полученных при доверительном управлении его пенсионными резервами. Суд удовлетворил иск и постановил выплатить фонду 230,9 млн руб. Аналогичный иск на 346,1 млн руб. к "Пиоглобал" позднее предъявил НПФ Сбербанка, требования были также удовлетворены, в результате управляющая компания обанкротилась.
В марте 2009 года четыре НПФ, включая "Норильский никель" и НПФ "Транснефти", обратились в ФСФР с просьбой оценить качество инвестирования пенсионных резервов управляющей компанией Росбанка, которая приобрела в состав активов НПФ акции малоизвестной компании "Финанс-лизинг" на 800 млн руб.
В апреле 2009 года вскрылись первые случаи мошенничества с пенсионными накоплениями граждан, которые переводили в разные НПФ без согласия застрахованных лиц. Председатель правления ПФР Антон Дроздов говорил "Ъ", что по итогам 2009 года было зафиксировано около 3 тыс. жалоб граждан на незаконный перевод их пенсионных накоплений.
В июне 2009 года НПФ "Сургутнефтегаз" потребовал от управляющей компании АВК "Дворцовая площадь" выплаты 22,1 млн руб. гарантированной доходности, прописанной в договоре. Иск удовлетворен.
Летом 2009 года ряд НПФ, в частности "Благосостояние" и "Транснефти", предъявили иски управляющей компании "РБизнес Управление активами" (прежнее название — управляющая компания Росбанка) с требованием возместить убытки от доверительного управления. Общая сумма требований клиентов компании превысила 4 млрд руб., в результате "РБизнес" подала на банкротство.
Летом 2010 года новое руководство Ханты-Мансийского НПФ провело аудиторскую проверку инвестиционной деятельности фонда, в результате которой выяснилось, что собственное имущество фонда инвестировано в векселя компании-банкрота, а "несколько миллиардов рублей" пенсионных резервов, вложенных в строительные объекты, заморожены.