В 1986 году 23-летний Георгий Боос окончил Московский энергетический институт по специальности "инженер-электрик световых приборов". После окончания военной кафедры вуза приказом министра обороны СССР от 28 января 1986 года ему было присвоено воинское звание лейтенант. Вскоре он защитил диплом и 3 марта 1986 года был призван в армию на два года, что было распространенной практикой в Советском Союзе. В среде профессиональных военных для выпускников вузов, не имеющих специального военного образования и призванных в вооруженные силы, было даже придумано специальное прозвище "пиджак" (именно "пиджаком" начинал свою военную карьеру генерал армии Анатолий Квашнин, в 1997-2004 годах занимавший пост начальника Генерального штаба).
Георгий Боос проходил службу в ВВС в городе Спасске-Дальнем Приморского края. В это время здесь базировались 821-й истребительный авиаполк ордена Суворова (самолеты МиГ-23МЛ) и 219-й отдельный дальний разведывательный авиаполк (самолеты Ту-16Р, Ту-16З и Ту-22М3). Георгий Боос занимался радионавигационным оборудованием, наземными и воздушными радиотехническими системами. По его словам, в армии он "играл в футбол, в хоккей... даже были свои поклонники". 5 марта 1988 года ему присвоено очередное воинское звание — старший лейтенант. В том же году он закончил свою службу. "Армия — один из интереснейших и важнейших периодов в моей жизни. Это школа, которая оказала большое влияние и на мировоззрение, и на становление",— заявил господин Боос в интервью газете "Труд" 26 октября 1999 года.