Высшими органами судебной власти у католиков являются три трибунала, входящие в состав Римской курии — главного административного органа Ватикана. Их решения редко становятся достоянием широкой общественности, поскольку в большинстве своем относятся к внутренним делам Церкви
Верховный трибунал Апостольской пенитенциарии был учрежден в XII веке. Он занимается рассмотрением вопросов, связанных с отлучением от Церкви, нарушениями церковных таинств, выдачей и отзывом индульгенций, устранением канонических неясностей и выдачей разрешений на брак. Однако в настоящее время трибунал чаще выступает не как суд первой инстанции, а как апелляционный суд. В 1988 году папа Иоанн Павел II определил, что в компетенцию этого трибунала входят также внутренние вопросы церковной жизни, например о нарушивших обет безбрачия священниках. В последний раз трибунал обратил на себя внимание широкой общественности в марте 2008 года. Тогда один из руководителей трибунала епископ Джанфранко Джиротти заявил, что исповедующим священникам стоит обращать внимание на "новые грехи": опыты с ДНК человека, загрязнение окружающей среды, употребление наркотиков, аборты, педофилию. Заявление вызвало широкий резонанс, поскольку СМИ оценили его как официальное расширение списка смертных грехов. Позже эксперты пояснили, что высказывания епископа не имеют канонической силы.
Апостольский трибунал Римской роты основан в XIII веке. Является высшим апелляционным судом Церкви и судом первой инстанции по любым делам, где ответчиком выступает священнослужитель в сане епископа или выше. Последний скандал, в разбирательстве которого принимал участие трибунал, разгорелся в 1999 году. Тогда в Италии в продаже появилась книга "Унесенные ветром в Ватикане", в которой утверждалось, что больной и немощный папа больше не управляет Церковью, клирики манипулируют церковными институтами в своих интересах и грешат сребролюбием, карьеризмом, клановостью и похотью. Некое частное лицо сочло, что в книге оскорблена честь его покойного дяди, ватиканского епископа, и по его просьбе было созвано специальное заседание Роты. Трибунал установил, что автор книги — прелат Луиджи Маринелли. От него потребовали изъять издание из продажи и воспрепятствовать его переводу на другие языки. Маринелли отказался, и был отлучен от причастия.
Верховный трибунал Апостольской сигнатуры — высшая судебная инстанция помимо самого папы римского и административная служба по судебной деятельности всей Церкви. Учрежден в XVI веке. Занимается рассмотрением жалоб на решения Роты, разрешает споры по поводу решений церковной администрации, между церковными ведомствами, продляет полномочия и создает новые церковные суды на местах. Решения Апостольской сигнатуры обжалованию не подлежат. Из известных решений трибунала — отказ в апелляции шри-ланкийскому богослову Тиссе Беласурийя, выступившему против большей части католических догм, он оспаривал признание его еретиком и отлучение от Церкви.