Судья Ярлыкова (была назначена на должность указом президента России в августе 2005 года сроком на три года, в ноябре 2008 года ее полномочия были продлены бессрочно) получила известность не только своим участием в рассмотрении громких дел, но и тем, что санкционировала аресты по таким делам. Именно она арестовала вице-президента ЮКОСа Василия Алексаняна, начальника департамента оперативного обеспечения Госнаркоконтроля Александра Бульбова, экс-руководителя Главного следственного управления следственного комитета при прокуратуре РФ Дмитрия Довгия, бывшего вице-президента "Евросети" Бориса Левина. Ею был санкционирован заочный арест Бориса Березовского (по делу о хищении $13 млн из банка "СБС-Агро") — причем это была уже шестая санкция на арест политэмигранта, выданная российскими судами. А в январе 2008 года Елена Ярлыкова продлила арест заместителю министра финансов РФ Сергею Сторчаку, обвиняемому в попытке хищения бюджетных средств (сейчас господин Сторчак находится на свободе).
Последним уголовным делом, которое рассматривала судья Елена Ярлыкова, стало дело руководителя подконтрольной ЮКОСу компании "Фаргойл" Антонио Вальдес-Гарсиа, в выдаче которого Испания отказала России. Судили господина Гарсиа в заочной форме. Теперь это дело передадут другому судье, а разбирательства начнут по нему со стадии предварительных слушаний.