13 сентября 2006 года в Москве совершено покушение на первого заместителя председателя Центробанка Андрея Козлова. Его водитель погиб на месте, чиновник умер в реанимации. 16 октября Генпрокуратура сообщила о задержании исполнителей убийства — трех граждан Украины. 5 декабря генпрокурор Юрий Чайка объявил о раскрытии убийства. В декабре под стражу взяли еще двух предполагаемых посредников, в том числе владельца холдинга "Русь-Алмаз" Бориса Шафрая.
10 января 2007 года арестована третья посредница — владелица ресторана "Триш" Лиана Аскерова, назвавшая заказчиком бывшего главу ВИП-банка Алексея Френкеля. 11 января он был задержан, 17 января ему предъявлено обвинение в организации убийства. По версии следствия, мотивом стала месть: в июне 2006 года по инициативе Андрея Козлова ЦБ отозвал лицензию у ВИП-банка.
В январе-феврале 2007 года в СМИ опубликованы три открытых письма Алексея Френкеля о коррупции в ЦБ. 4 апреля Лиана Аскерова отказалась от показаний, указав, что фамилию Френкеля ей "продиктовали для явки с повинной следователи". 5 апреля Алексею Френкелю предъявлено обвинение в окончательной редакции.
22 мая расследование завершено, в отдельное производство выделено дело еще одного соучастника, объявленного в розыск. Обвиняемые начали знакомиться с 59-томным делом.
24 января 2008 года заместитель генпрокурора Виктор Гринь утвердил обвинительное заключение и направил дело в Мосгорсуд. 5 февраля начался процесс, который по требованию Алексея Френкеля и других подсудимых проходил с участием присяжных. 25 марта по настоянию гособвинения суд был закрыт для публики по соображениям безопасности. Процесс отметился скандалами: банкира несколько раз выгоняли за "некорректное поведение", он два раза сидел в карцере, объявлял голодовку и обвинил судью Наталью Олихвер и обвинителей в сговоре. Из коллегии присяжных было выведено четверо: один — по подозрению в подкупе запасных заседателей, двое — за распитие пива в общественном месте, четвертая — за разговоры на улице с неизвестными людьми.
13 октября судебное следствие завершено. 28 октября присяжные признали всех обвиняемых виновными.