18 мая 2007 года СМИ сообщили о задержании в Санкт-Петербурге членов экстремистской группировки, готовившей покушение на губернатора города Валентину Матвиенко. 19 мая госпожа Матвиенко подтвердила информацию о готовившемся покушении и сообщила, что чувствует себя "спокойно и уверенно и не намерена усиливать охрану". После этого ФСБ объявила о задержании 16 мая двух жителей Ленинградской области и изъятии у них двух гранат Ф-1 и 500 г пластита.
23 мая директор ФСБ Николай Патрушев заявил, что задержанные, возможно, "связаны с религиозным экстремизмом". Он уточнил, что пойманы четыре человека, двое из которых отпущены под подписку о невыезде. 13 июня одному из ранее отпущенных изменили меру пресечения на арест, второго переквалифицировали в свидетеля.
2 ноября УФСБ передало дело в городской суд Санкт-Петербурга. Тогда же стали известны имена подозреваемых и суть предъявленных им обвинений. 29-летнего инженера Тимура Саидгареева и 20-летнего компьютерщика Равиля Муратова обвинили по ст. 30 (приготовление к преступлению), ст. 222 (незаконное хранение боеприпасов), ст. 277 (посягательство на жизнь государственного деятеля), ст. 205 (теракт) и ст. 205.1 (содействие террористической деятельности). 17-летний учащийся ПТУ Владислав Баранов получил обвинения по тем же статьям, за исключением ст. 205.1. По версии следствия, с марта 2007 года обвиняемые совместно с Федором Товпинцом (ставшим свидетелем по делу) собирались на квартире у выходца из Чечни Муслима Ильмурзаева и обсуждали возможность покушения на губернатора в отместку за "притеснение мусульман". ФСБ через подставных лиц вывела их на продавцов взрывчатки, во время покупки они были задержаны.
23 января 2008 года суд сформировал коллегию присяжных и 30 января приступил к рассмотрению дела.