На думских выборах 2003 года ни одна из партий не была лишена регистрации, хотя снятие с предвыборной дистанции грозило Народно-республиканской партии и движению "За Русь святую", в документах которой ЦИК обнаружил ряд серьезных нарушений. На выборах 1999 года "отказников" было больше. В самую громкую историю со снятием с выборов тогда попала ЛДПР: ЦИК не зарегистрировал ее партсписок из-за того, что ряд кандидатов предоставили неверные сведения о доходах. Но партийцы нашли выход из ситуации и учредили новое избирательное объединение — "Блок Жириновского", набравший на выборах 5,98% голосов. В 1999 году регистрации также лишилась Экологическая партия России "Кедр", из первой тройки которой вышли два кандидата. Движение "Спас", список которого возглавил лидер РНЕ Александр Баркашов, потеряло право участвовать в выборах после отмены судом решения о его госрегистрации. В регистрации также отказали, в частности, мусульманскому движению "Нур" (его финансовый отчет и документы о внесении залога поступили в ЦИК после положенного по закону срока) и движению "Русский дом", которое вопреки законодательству изменило свое название в ходе предвыборной кампании. В итоге в 1999 году в выборах участвовало 26 избирательных объединений, а в 2003 году — 23.