14 сентября 1997 года в ряде СМИ появилась информация о том, что на первого вице-премьера правительства РФ Анатолия Чубайса готовится покушение. В ФСБ подтвердили, что располагают информацией из Тюмени, согласно которой одна из местных ОПГ получила заказ на устранение господина Чубайса. СМИ предположили, что заказчиком мог выступать гендиректор нефтяной компании "Нижневартовскнефтегаз" Виктор Палий. Начался скандал, однако в итоге достоверных сведений о причастности Виктора Палия к подготовке покушения найдено не было.
15 сентября 1997 года помощник Анатолия Чубайса Андрей Трапезников, сославшись на "источники в ФСБ", заявил, что на его руководителя готовится покушение в связи с принятыми решениями по ужесточению налогообложения финансовых структур. По словам господина Трапезникова, возможным исполнителем могла выступать одна из чеченских группировок. В ноябре 1998 года СМИ процитировали первого зампреда службы национальной безопасности Ичкерии Исмаила Дадалаева, который сказал, что "ФСБ нейтрализовала план физического устранения Чубайса исключительно благодаря помощи спецслужб Ичкерии", которые "добыли оперативные данные о подготовке его убийства".
18 ноября 1997 года в информагентствах появились сообщения о том, что минувшей ночью на Алтуфьевском шоссе был обстрелян автомобиль Анатолия Чубайса. В тот же день ФСО заявила, что обстрелянный автомобиль ГАЗ-24 не принадлежит правительственному гаражу и не используется господином Чубайсом.
26 ноября 2003 года в Москве на пресс-конференции в сторону председателя правления РАО "ЕЭС России" Анатолия Чубайса был брошен пакетик с майонезом. Майонез не попал в цель, но задел стаканы на столе президиума. На господина Чубайса покушалась 23-летняя жительница Смоленской области, оказавшаяся членом Национал-большевистской партии.
17 ноября 2004 года в интервью Financial Times глава РАО ЕЭС заявил, что на него трижды готовилось покушение (последний раз — в 2002 году). Господин Чубайс признал, что ему известны детали готовившихся покушений и имена исполнителей, а предотвратить их помогла служба безопасности энергохолдинга.