24 октября 2002 года прокуратура Краснодарского края предъявила обвинение в получении взятки начальнику Новороссийской таможни Виталию Дрику. Таможенник был задержан после встречи с бизнесменом, который передал ему $20 тыс. Прокуратуру Новороссийска в то время возглавлял Михаил Бакулин. 3 декабря 2003 года Виталия Дрика приговорили к 4 годам заключения.
В декабре 2002 года прокуратура Новороссийска, возглавляемая Михаилом Бакулиным, возбудила дело по факту нецелевого использования горадминистрацией $7 млн из фонда развития города. Весной 2003 года дело передано в прокуратуру Кубани, куда в мае 2003 года на должность зампрокурора пришел Михаил Бакулин. В качестве подозреваемых в деле фигурируют бывший глава администрации Новороссийска Валерий Прохоренко, председатель комитета по управлению муниципальным имуществом Петр Коваленко, исполнительный директор Фонда развития Новороссийска Игорь Подколзин. Расследование не закончено.
16 августа 2004 года по итогам проверки Краснодарского краевого контрольно-ревизионного управления краевая прокуратура возбудила дело против двух заместителей главы администрации Краснодара — Ивана Левченко и Павла Вертлиба. Чиновники обвиняются в "превышении полномочий" в пользу ряда фирм, занимавшихся строительством в новых жилых микрорайонах. Дело передано в суд.
25 августа 2004 года прокуратура Краснодарского края возбудила дело против председателя гордумы Краснодара Александра Кирюшина по обвинению в нарушении налогового законодательства: по так называемым распределительным письмам, которые спикер якобы подписывал, значительные суммы местных налоговых платежей уходили не в горбюджет, а зачислялись на счета неких коммерческих структур. В начале сентября решением гордумы господин Кирюшин отозван с должности председателя, находится под подпиской о невыезде. Дело передано в суд. Слушания по существу назначены на 22 декабря.
31 августа 2004 года прокуратура Краснодарского края возбудила дело в отношении мэра Краснодара Николая Приза. Его обвиняют в единоличном распределении между генподрядчиками строительных работ, финансируемых из горбюджета. В начале октября решением суда господин Приз отстранен от должности, находится под подпиской о невыезде. Дело передано в суд.