В 2013 году из состава Воронежской епархии были выделены самостоятельные Борисоглебская и Россошанская епархии. С этого момента в ведении Воронежской кафедры остались города Воронеж и Нововоронеж, Верхнехавский, Каширский, Лискинский, Нижнедевицкий, Новоусманский, Рамонский, Семилукский и Хохольский районы. Тогда же Воронежская епархия была определена центром новоучрежденной Воронежской митрополии, правящий архиерей епархии носит титул митрополита Воронежского и Лискинского.
По состоянию на начало 2019 года Божественная литургия (еженедельно и чаще одного раза в месяц) совершается в 194 храмах епархии. На приходах и в святых обителях несут служение около 300 штатных священнослужитей. Действуют три монастыря: Свято-Успенский Дивногорский мужской и женские Алексиево-Акатов в Воронеже, Спасо-Преображенский Толшевский на станции Графская в Воронежском заповеднике. В монастырях подвизаются более 80 человек.
В епархии работают несколько учебных заведений: Воронежская духовная семинария, православная гимназия во имя святителя Митрофана Воронежского, Центр духовно-нравственного воспитания Воронежского областного института повышения квалификации и переподготовки работников образования.
«Хочется, чтобы мы все стали по-настоящему свободными людьми»
Митрополит Воронежский и Лискинский Сергий о взаимосвязи церковной и светской жизни в регионе