Первым опытом парламентского расследования стало создание в январе 1995 года в Госдуме комиссии по расследованию причин и обстоятельств возникновения кризисной ситуации в Чеченской Республике (комиссия Станислава Говорухина). Комиссия провела 112 заседаний, опросила 450 человек и возложила основную ответственность за конфликт на президента Бориса Ельцина.
В 1998 году депутаты создали комиссию по импичменту Бориса Ельцина. Около года она трудилась над составлением обвинений против главы государства. В результате ни по одному из пунктов обвинения не было набрано необходимых 300 голосов для принятия решения.
20 сентября 2004 года Совет федерации с участием Госдумы создал комиссию по расследованию причин и обстоятельств теракта в Беслане во главе с Александром Торшиным. В обнародованном в 2006 году докладе комиссия признала, что власти "приняли все возможные меры, направленные на сохранение жизни людей". Главными виновниками были названы боевики и милиционеры, которые не смогли их заранее перехватить.
29 декабря 2005 года вступил в силу федеральный закон "О парламентском расследовании", позволивший расследовать "факты грубого или массового нарушения прав и свобод человека", причины и последствия чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера, а также "факты грубого нарушения финансовой дисциплины". Первым и единственным пока расследованием но новому закону стало расследование причин аварии на Саяно-Шушенской ГЭС 19 августа 2009 года, инициированное КПРФ и "Единой Россией" в сентябре того же года. В декабре комиссия пришла к выводу, что авария произошла из-за низкой квалификации персонала ГЭС, и назвала 19 человек, причастных, по ее мнению, к ЧП.
Думская оппозиция неоднократно пыталась инициировать расследования многих других вопросов — массовых беспорядков в карельском городе Кондопога и на Манежной площади, расследование деятельности министра образования Дмитрия Ливанова, "катастрофические последствия" военной реформы и др. Однако эти инициативы не находили поддержки парламентского большинства.