В марте--апреле 2006 года возглавляемый Геннадием Онищенко Росприроднадзор ввел запрет на ввоз вин и коньяков из Молдавии и Грузии. Решение объяснили выявлением в этих товарах повышенного содержания пестицидов и железа. Поставки молдавской продукции возобновились в ноябре 2007 года, запрет на грузинский алкоголь сохраняется до сих пор.
С мая 2006 года действует запрет на ввоз и реализацию в России грузинских минеральных вод "Боржоми" и "Набеглави". По данным Росприроднадзора, их производители нарушают санитарные требования.
В ноябре 2006 года в Москве была запрещена реализация рыбных консервов ряда латвийских производителей, в которых специалисты Роспотребнадзора обнаружили высокую концентрацию бензопирена. Вскоре на этом основании Россельхознадзор запретил импорт в Россию рыбной продукции двух крупнейших латвийских рыбзаводов Gamma-A и Brivais Vilnis. Он был отменен в январе 2007 года.
В июне 2009 года из-за несоответствия новому техрегламенту запрещен ввоз около 1,5 тыс. наименований молочной продукции из Белоруссии. Поставки возобновились через месяц, когда белорусские производители выполнили все требования российской стороны.
В мае 2010 года Роспотребнадзор предписал прекратить реализацию партии фарфоровой посуды белорусского производства, в которой выявил повышенное содержание кадмия и свинца.