17 октября 1994 года при взрыве бомбы в редакции газеты "Московский комсомолец" погиб журналист Дмитрий Холодов. Задержанные в 1998 году якобы мстившие ему за публикации шестеро человек, в том числе экс-начальник разведки ВДВ Павел Поповских, дважды оправданы судом.
1 марта 1995 года в Москве застрелен гендиректор ОРТ Владислав Листьев. На следующий день президент Борис Ельцин публично пообещал, что убийцы понесут наказание, но преступление остается нераскрытым.
8 июня 1998 года под Элистой найдено тело главного редактора оппозиционной газеты "Советская Калмыкия сегодня" Ларисы Юдиной. Убийцы — бывший помощник президента Калмыкии и местный уголовник — задержаны через несколько дней. 29 ноября 1999 года Верховный суд Калмыкии приговорил каждого к 21 году, признав, что с журналистом расправились за его профессиональную деятельность.
12 мая 2000 года в Москве избит до смерти глава отдела спецпроектов "Новой газеты" Игорь Домников. 28 августа 2007 года Верховный суд Татарии в том числе и за это убийство приговорил к пожизненному заключению четырех членов тагирьяновского преступного сообщества. Заказчик официально не найден.
29 апреля 2002 года застрелен главный редактор "Тольяттинского обозрения" Валерий Иванов, а 9 октября 2003 года зарезан его преемник Алексей Сидоров. Оба убийства не раскрыты.
9 июля 2004 года в Москве застрелен главред русской версии журнала Forbes Пол Хлебников. По версии следствия, за книгу "Разговор с варваром" ему отомстил чеченец Хож-Ахмед Нухаев. В 2006 году двое исполнителей оправданы Мосгорсудом, однако Верховный суд направил дело на новое рассмотрение.
7 октября 2006 года в Москве застрелена журналистка "Новой газеты" Анна Политковская. Следствие считает убийство местью за публикации, но установить заказчика пока не смогло. Дело возможного организатора и двух исполнителей ожидает повторного рассмотрения в Мосгорсуде.
12 ноября 2008 года избит главный редактор газеты "Химкинская правда" Михаил Бекетов, активно выступавший против вырубки Химкинского леса. В результате журналист стал инвалидом. О задержанных и подозреваемых не сообщалось.
19 января 2009 года в центре Москве были застрелены журналистка "Новой газеты" Анастасия Бабурова и адвокат Станислав Маркелов, известные поддержкой антифашистских движений. В преступлении обвиняют националистов Никиту Тихонова и Евгению Хасис.