Образовано в ходе административной реформы 9 марта 2004 года, получило функции упраздненных Министерства образования, Агентства по патентам и товарным знакам, а также часть функций Министерства промышленности, науки и технологий. В 2010 году получило функции еще двух упраздненных федеральных агентств — Рособразования и Роснауки. Курирует все уровни образования, воспитание и социальную защиту детей, профилактику безнадзорности и правонарушений несовершеннолетних, защиту интеллектуальной собственности, научную, научно-техническую и инновационную деятельность. В структуре ведомства 16 департаментов. В ведении министерства находятся Федеральное агентство по делам молодежи (Росмолодежь) и Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки (Рособрнадзор). Под контролем министерства — более 102 тыс. учебных заведений, в которых обучаются около 30 млн человек. Запланированные расходы бюджета на министерство в 2015 году — 388,4 млрд руб., на 2016 и 2017 годы — 427,4 млрд руб. и 455,1 млрд руб. соответственно.