В 1992 году глава ассоциации "Степь" Кирсан Илюмжинов получил от правительства России кредит в 14 млрд руб. на закупку шерсти. В 1993 году прокурор республики Владимир Шипиев заявил, что 9,4 млрд руб. кредита похищены, и возбудил уголовное дело. В 1999 году, после того как один свидетель неожиданно умер, а второй отказался давать показания, дело закрыли. Виновных так и не нашли.
7 июня 1998 года неизвестные убили сопредседателя калмыцкого регионального отделения партии "Яблоко", редактора газеты "Советская Калмыкия сегодня" Ларису Юдину. Она активно критиковала деятельность калмыцкого руководства. В качестве подозреваемых арестовали бывшего помощника президента Калмыкии Сергея Васькина, представителя президента Калмыкии в Волгоградской области Тюрбу Босхомджиева и безработных Владимира Шанукова и Сергея Липина. 29 ноября 1999 года Верховный суд Калмыкии приговорил Сергея Васькина и Владимира Шанукова к 21 году тюрьмы. Тюрбу Босхомджиева не осудили за помощь следствию, о Сергее Липине не сообщалось.
В 2002 году главное управление собственной безопасности МВД России на основании проверки пришло к выводу, что глава калмыцкого МВД Тимофей Сасыков поддерживает браконьеров и подпольных нефтеторговцев, оказывает давление на политическую оппозицию и предоставляет убежище чеченским боевикам. 7 мая 2003 года его отправили в отставку. Тимофея Сасыкова обвинили в превышении должностных полномочий и присвоении власти — после отставки он отказался оставить пост. 7 июня 2004 года Верховный суд Калмыкии признал его виновным в злоупотреблении полномочиями и служебном подлоге и оштрафовал на 250 тыс. руб.
В ночь с 7 на 8 августа 2004 года в Элисте убили Раису Убушиеву, владелицу нескольких газетных киосков, ее мужа Владимира Кислова и ее мать Цаган Убушиеву. По сообщениям СМИ, неизвестные требовали от госпожи Убушиевой изъять из продажи журнал "Компромат.Ru", посвященный деятельности Кирсана Илюмжинова, но она отказалась. Прокурор Калмыкии Сергей Хлопушин не стал санкционировать задержание подозреваемого, и дело развалилось.